#261【種同定の基礎】塩基配列の相同性検索。

投稿日:2023/05/17


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腸内細菌相談室の鈴木大輔です。

今回のエピソードでは、塩基配列を用いた種同定で欠かせない相同性検索について、大まかな流れとBLASTについてお話しました!

国立遺伝学研究所, 相同性検索プログラムBLASTの内部構造: https://www.ddbj.nig.ac.jp/activities/blast-doc.html

奈良先端大, ペアワイズアライメントと配列相同性解析配列相同性解析: http://isw3.naist.jp/IS/Kawabata-lab/LECDOC_KINDAI/2010/alignment_10Apr20_print.pdf

BLAST論文:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/2231712/

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メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)~6月16日 (金) まで、クラウドファンディングに挑戦しています。「腸内細菌ドナー」や「腸内細菌叢バンク」のサポーターになってみたいという方はこちらのページをご確認ください。


●腸内細菌叢バンク/クラウドファンディングについて

https://www.metagentx.com/microbiome-bank/

 

メタジェンセラピューティクス株式会社について

メタジェンセラピューティクス株式会社は「マイクロバイオームサイエンスで患者さんの願いを叶え続ける」ことをミッションとして、腸内細菌研究に基づいた医療と創薬でソーシャルインパクトを生み出す大学発ベンチャーです。順天堂大学の医師と慶應義塾大学、東京工業大学の研究者が共同創業し、「腸内細菌叢移植療法(FMT)」の社会実装と、「FMT起点のリバーストランスレーショナル創薬」を推進しています。


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